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对大多数细菌性疾病来说，都为用常规方法研究出来的活疫苗，而大多数的灭活疫苗效果均不理想。我国对细菌性疾病的控制主要靠维生素，因抗生药越来越严重，不仅使成本增高，而且对食品安全构成重要威胁。因此用新的方法研究重要细菌病的疫苗已经很为迫切。对基于DNA重组技术和分子生物学的新型疫苗，有几点共同的要求：（1）安全性应高于现有的常规疫苗；（2）免疫效力如不能显著高于常规疫苗，至少应与常规疫苗相当；（3）价格大致与常规疫苗相等；（4）解决一些常规疫苗无法解决分问题，如区分自然感染和疫苗应答等。 （2）现状 世界上已经获得许可正在使用和正在研究的新型疫苗有4类：1类是灭活产品，如重组蛋白疫苗；2类产品为基因缺失的病原体制成的基因缺失疫苗；3类是表达插入基因的载体基因；4类是基因疫苗活DNA疫苗。 在1类产品中，有重组α和γ干扰素，和其他细胞因子。α干扰素对有些病毒感染有明显抑制作用，而γ干扰素则有增强MHCП类分子表达，提高增重等作用。在疫病流行期间或受到疫病威胁时，可通过对动物大面积接种疫苗使之免遭传染病侵袭；另一方面，疫苗免疫接种在保护动物不受感染的同时，还可防止病毒向人类传播。世界卫生组织提出，70%以上的动物免疫率就可以切断狂犬病由犬到人的传播。在看到疫苗免疫取得成效的同时，我们也要看到疫苗的大量使用也会带来诸多隐患。首先，疫苗本身有可能会引起不良反应，像灭活剂与疫苗接种后，有时会加大机体的反应。

佐剂在增强机体免疫反应的同时，也会引起或增强迟发型超敏反应，有时还会在注射部位产生肉芽肿和关节炎；其次，现在使用的部分疫苗属于致弱疫苗，如果使用不当，反而可能导致动物发病；第三，疫苗超剂量使用，免疫压力加大，加上选择性突变，有可能导致强毒株、超强毒株、特超强毒株出现，使疫病的防控更加复杂和困难。疫苗接种就像一把双刃剑，在降低畜禽感染疾病的同时又会带来新的风险。

因此，防控疫病时必须规范合理使用疫苗，同时还需采取综合防控措施，共同构筑阻挡疫病传入“防火墙”。疫苗是将病原微生物（如细菌、立克次氏体、病毒等）及其代谢产物，经过人工减毒、灭活或利用转基因等方法制成的用于预防传染病的自动免疫制剂。疫苗保留了病原菌刺激动物体免疫系统的特性。当动物体接触到这种不具伤害力的病原菌后，免疫系统便会产生一定的保护物质，如免疫激素、活性生理物质、特殊抗体等；当动物再次接触到这种病原菌时，动物体的免疫系统便会依循其原有的记忆，制造更多的保护物质来阻止病原菌的伤害。

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如果残余毒力到一定程度，虽然能产生坚强免疫，但本身可产生临床或亚临床疾病，在IBD疫苗的情况下还产生对其他病得免疫抑制。疫苗残余毒力是免疫副反应的主要原因，如鸡群中使用传染性支气管炎（IB）和鸡新城疫（ND）活疫苗引起呼吸道病副反应，猪群使用繁殖和呼吸综合症（PRSR）活疫苗也产生副反应，这些都常见。除残余毒力外，弱毒活疫苗存在一个更大的问题是疫苗毒株和野毒株之间发生重组，导致新毒株的出现。

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用真核或原核表达的重组蛋白制成的亚单位疫苗，也属于这一类，但在动物疫苗领域已批准使用的还不多。 在2类产品中，有基因缺失疫苗或标记疫苗，即将毒力相关和抗体产生相关的特定基因删除或改变，血清学检测时能区分野毒感染和疫苗应答。畜禽用基因缺失疫苗成功的例子是猪伪狂犬病和肠炎沙门氏菌（SE）疫苗及鼠伤寒沙门氏菌疫苗，因为疫苗株均删除了致病基因，使用很安全。 在3类产品中，用作载体的有鸡痘病毒、鸡马立克氏病毒（HVT和MDVⅠ型）、腺病毒等，和沙门氏菌等细菌。载体疫苗的研究已有近20年的历史，涉及的动物疫苗有很多种，全世界已被批准的有鸡痘病毒为载体的MD疫苗、ND疫苗等，但到目前为止获得大规模推广应用还不多。如果是进针时，针头向下，就有可能注射到皮下的表皮肌肉之中了。这样，就会导致所注射的疫苗在体内很快产生大量的抗体，在疫苗注射后的短期内就可以在动物身体中形成比较高的抗体滴度（因此，这种方法主要应用于紧急免疫）。由于抗体产生的速度很快，也能很快的达到峰值，但是，也能够很快的在体内开始下降，从而缩短了抗体在体内维持有效滴度的时间，导致不少的毛皮动物在注射疫苗之前就开始发病。

养殖人员在展开动物疫苗接种时，需要将这些疫苗放置在专门的保温箱中，注射接种环节也需要引起足够的重视，该环节也是疫苗冷链运输的后一环。油乳疫苗在保存过程中需要将温度控制在2℃～8℃，避免和冰块进行直接的接触。冻干疫苗需要冰块保存，但是需要注意的是不能反复冻干，否则会影响到疫苗的活性。该疫苗在使用过程中需要工作人员借助生理盐水将其溶解，并在规定的时间内完成使用，防止出现疫苗失效。

为了抵御疫病，养殖户大量使用农药和抗生素，造成禽畜产品体内残留超标，在发达我国的"绿色壁垒"面前，中国禽畜产品的出口受阻。总体而言，相对于发达我国，目前我国动物养殖规模化程度总体还比较低，散养以及小规模养殖仍然占畜牧业较大比例，同时，大规模扑杀模式所需资金较大，相关经常性补偿机制在我国尚未形成。因此，我国无法像发达我国那样采用“疫区扑杀为主、接种疫苗预防为辅”的防疫模式。

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不过，要有效控制乃至消灭传染病，单靠疫苗是不够的，因为没有解决传染源和传播途径的问题。我国在应用疫苗控制畜禽疫病中存在认识误区，即过分地依赖疫苗，这种思想存在于相当一部分决策的领导人中，也存在于一些经营者和技术人员中。我们只有正确认识疫苗在控制乃至消灭畜禽传染病中的作用，才能把握疫苗研究的方向，才能正确使用疫苗。我国动物疫苗企业，大多数规模较小且竞争激烈。